Commune rurale du sud Seine-et-Marne, Villemer est située dans le bocage gâtinais, entre la vallée du Loing et la vallée de la Seine et de l'Yonne.

Elle appartient à l'arrondissement de Fontainebleau, dépend du canton de Nemours et est rattachée à la communauté de communes Moret Seine & Loing. Elle est composée du bourg et de 6 hameaux, Rebours, Villeron, Le Luat, Montmery, Le Coudray et Le Gallois.

La commune compte 755 habitants et s'étend sur 1 854 hectares.

Les citoyens de Villemer sont les Villemeroises et Villemerois.